2016中華職棒二軍總冠軍賽由中信兄弟與Lamigo在屏東棒球場展開五戰三勝制的比賽,首戰中信兄弟靠著詹子賢和蘇緯達連續兩局擊出back-to-back全壘打的帶領下,幫助球隊取得旗開首勝。
中華職棒大聯盟在二軍總冠軍賽的開幕儀式中進行本季二軍賽年度個人獎項的表揚,並由吳志揚會長親臨頒獎。獎項得主如下:防禦率王「蔡萬霖」(統一);勝投王「林家瑋」(統一);中繼王「林正豐」(義大);救援王「陳煥揚」(義大);奪三振王「郭力瑋」(統一);打擊王「曾陶鎔」(中信兄弟);安打王「徐育澄」(義大);全壘打王「陳敏賜」(Lamigo);打點王「蔡益民」(中信兄弟);盜壘王「翁克堯」(Lamigo)。
中信兄弟林智勝本季30轟達成,成為聯盟史上首位連續2年達成30轟、生涯第3度單季30轟的打者。同時,除了與隊友蔣智賢並列全壘打王外,也讓中信兄弟成為聯盟史上首支單季2位30轟球員的球隊。